Байесовский анализ совместно с технологией генного редактирования CRISPR/Cas9
Пт, 10 Авг 2018
86
Байесовский анализ совместно с технологией генного редактирования CRISPR/Cas9

Американские ученые использовали новую вычислительную стратегию для того, чтобы определить 29 генетических изменений, которые способствуют развитию рабдомиосаркомы, агрессивного злокачественного новообразования у детей. Для того чтобы подтвердить статистические прогнозы ученые использовали Байесовский анализ совместно с технологией генного редактирования CRISPR/Cas9.

Исследование ученых помогает объяснить причины формирования рабдомиосаркомы и определить потенциальные методы лечения. Более того данный метод может помочь выявить генетические движущие силы других типов злокачественных новообразований.

Практически все гены в клетках встречаются парами. Исследователи сосредоточили свое внимание на генах, которые имели только одну копию или которые имели три и более копии. Ученые полагали, что причиной изменений в экспрессии ключевых генов злокачественных новообразований может являться увеличение числа геномных копий или их потеря. Исследователи разработали алгоритм, который прогнозирует гены злокачественных новообразований на основе числа копий во всем геноме и данных об экспрессии генов.

Используя данный алгоритм, ученые провели анализ данных 290 опухолей детей с рабдомиосаркомой. Им удалось определить 29 генов, многие из которых ранее не связывали с данным заболеванием. Среди выявленных генов ученые особо выделяют EZH2, CDK6, и RIPK2, поскольку уже существуют препараты, которые воздействуют на данные гены.

В дальнейшем группе ученых необходимо определить роль, которую гены, выявленные с помощью новейшего алгоритма, играют в формировании злокачественных новообразований. Данный алгоритм представляет собой общий подход, который может быть использован для определения генов, которые запускают процесс развития злокачественных новообразований или же подавляют рост опухоли, при других типах злокачественных новообразований.

Источник: https://www.univadis.ru 
Опубликовано: ScienceDaily, New tools used to identify childhood cancer genes 

 

 

Похожие статьи

Топ 10 за все время