Сравнение частоты встречаемости однонуклеотидного варианта CYP3A5*3 в этнических группах русских и нанайцев
501
Вт, 23 Янв 2018

Введение


Эффективность и безопасность медикаментозного лечения зависит от особенностей  фармакокинетики, фармакодинамики и метаболизма используемых препаратов.  Важную роль в метаболизме лекарственных веществ играют ферменты группы  цитохрома P450. Эти ферменты различны по своей структуре и благодаря этому  метаболизируют большую часть ксенобиотиков. Например, ген CYP3A5 участвует в  метаболизме иммуносупрессивных препаратов, антиретровирусных средств,  антигипертензивных средств из группы блокаторов кальциевых каналов. Однако  имеются данные о разной эффективности и безопасности иммуносупрессивных препаратов в аналогичных группах пациентов. Это явление  может быть вызвано присутствием в популяции различных вариантов  последовательности нуклеотидов в гене цитохрома. Так, известно, что у носителей однонуклеотидного варианта CYP3A5*3 (A6986G, rs776746) скорость работы  цитохрома снижена. В группе пациентов-носителей генотипа GG, концентрация  такролимуса была достоверно выше, чем у носителей других вариантов генотипов [1].  У пациентов с генотипом GG могут более выраженно проявиться эффекты гепатотоксичности такролимуса [2]. Кроме того, известны межэтнические  различия в частоте этого полиморфизма. Некоторые исследователи полагают, что  частота встречаемости CYP3A5*3 напрямую зависит от удалённости региона от  экватора. Так, в африканской популяции данный полиморфизм встречается наиболее редко (0,06 в Нигерии), а в европейской (0,96 во Франции) и  восточноазиатской популяциях (0,95 в Китае) наиболее часто [3]. В связи с этим  представляет большой интерес изучение частоты данного полиморфизма в разных  этнических группах России. 


Цель


Изучить частоту встречаемости однонуклеотидного варианта CYP3A5*3 (A6986G,  rs776746) в этнической группе нанайцев, сравнить с литературными данными по  встречаемости этого варианта в этнической группе русских.


Материалы и методы


Изучаемая популяция. В исследование были включены 70 здоровых добровольцев из  этнической группы нанайцев, средний возраст 43,5 лет (от 22 до 70 лет). Все  добровольцы были проинформированы о целях и методах исследования, дали своё  добровольное информированное согласие на участие в исследовании и на забор  генетического материала. 
Критерии включения: принадлежность добровольцев к этнической группе нанайцев,  что определялось путём самоидентификации добровольцев и их родителей [4]. 
Критерии невключения: в исследование не включали близких родственников (братьев,  сестёр, родителей) и потомков разноэтнических браков. 
Генотипирование. Для определения полиморфизмов у добровольцев забрали 5 мл  венозной крови в вакуумные пробирки с реактивом ЭДТА, забор крови осуществляли  на базе амбулатории краевого ГБУ здравоохранения «Троицкая ЦРБ» МЗ Хабаровского  края, с. Найхин. Образцы в замороженном состоянии доставлены в НИЦ ФГБОУ ДПО  РМАНПО МЗ РФ, где проводили выделение ДНК из лейкоцитов крови с использованием  набора Научно-производственной фирмы «Синтол». Выделенную ДНК изучали на носительство однонуклеотидного варианта (SNV) CYP3A5*3 (A6986G, rs776746)  методом Real-Time PCR с помощью набора Научно-производственной фирмы «Синтол»  производства России, Москва, на амплификаторе RealTime CFX96 Touch (Bio-Rad  Laboratories, Inc., USA). Программа включала предварительную денатурацию при 95 °С  в течение 3 мин, затем 40 циклов: денатурация при 95 °C в течение 15 секунд, отжиг  при 63 °C в течение 40 минут. 

Популяция сравнения. В качестве группы сравнения выбрали популяцию русских,  поскольку это самая крупная этническая группа в России. Набор популяции проводили  по литературным данным с использованием поисковой системы NCBI Pubmed. 

Статистический анализ. Был проведён тест Харди–Вайнберга для подтверждения  независимого распределения аллелей в изучаемых полиморфизмах. Точный тест  Фишера использовали для оценки различий частот встречаемости различных аллелей  между нанайской и русской этническими группами. Статистические данные  обрабатывались в программе INSTAT.


Результаты


По данным исследования [5] были обследованы 229 здоровых добровольцев из  этнической группы русских. 
Генотип AA по CYP3A5*3 обнаружен не был, AG встречался у 11 % (n = 25), GG у 89 %  (n = 204) обследованных, частота А аллели составила 0,05, частота G аллели 0,95. Хи- квадрат по Харди–Вайнбергу составил 0,76, р = 0,6837. 
У 70 здоровых добровольцев из нанайской этнической группы определили частоту  CYP3A5*3. Генотип AA встречался в 2,9 % (n = 2) случаев, AG – в 11,4 % (n = 8)  случаев, GG в 85,7 % (n = 60) случаев. Частота А аллели составила 0,09, G аллели  0,91. Хи квадрат по Харди–Вайнбергу составил 5,13, р = 0,0799. 
Частота носительства G аллели по CYP3A5*3 (A6986G), статистически не различалась в  группах русских и нанайцев OR = 0,62, 95 % CI [0,30–1,26], р = 0,23. 


Заключение


В данном исследовании была определена частота встречаемости однонуклеотидного  варианта CYP3A5*3 (A6986G, rs776746) в этнической группе нанайцев, распределение  генотипов соответствовало закону Харди–Вайберга. Также мы сравнили частоту этого  SNV с русской популяцией по данным литературы. Мы не нашли статистически  значимых различий в частоте CYP3A5*3 (A6986G) между группами, однако наше  внимание привлекла высокая распространённость «медленных» метаболизаторов в  обеих этнических группах (частота G аллели была 0,95 у русских и 0,91 в нанайской  этнической группе). Более высокая концентрация цитостатиков у носителей генотипа  GG может приводить к развитию гепатотоксичности [1]. Фармакогенетические исследования в этой области могут способствовать  персонализации режимов дозирования для пациентов, принимающих препараты- субстраты CYP3A5. Кроме того, полученные результаты могут помочь в принятии решений о внедрении фармакогенетического тестирования в клиническую  практику на территории Российской Федерации. 


Литература


1. Xue F., Han L., Chen Y., Xi Z., Li Q., Xu N. et al. CYP3A5 genotypes affect tacrolimus pharmacokinetics and infectious complications in Chinese pediatric liver transplant patients, 2014 Mar, 18 (2): 166–76.
2. Thompson E.E., Kuttab-Boulos H., Witonsky D., Yang L., Roe B.A., Di Rienzo A. CYP3A Variation and the Evolution of Salt-Sensitivity Variants. Am J Hum Genet, 2004 Dec, 75 (6): 1059–1069.
3. Yasmina A., Deneer V.H., Maitland-van der Zee A.H. et al. Application of routine electronic health record databases for pharmacogenetic research. J Intern Med, 2014, 275 (6): 590–604.
4. Hua Tang, Tom Quertermous, Beatriz Rodriguez et al. Genetic Structure, Self-Identified Race/Ethnicity, and Confounding in Case-Control Association Studies. Am. J. Hum. Genet, 2005, 76: 268–275.

Похожие статьи

Топ 10 за все время